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短信已读但仍有红色的通知，可能有以下几种原因。
1、软件设置问题：某些短信应用程序可能默认设置即使已读的消息仍然显示通知，可以进入软件的设置或通知管理界面，找到相关的短信应用，然后关闭或调整相关的通知设置。
2、系统通知机制：在某些情况下，即使短信已经被读取，系统仍然会发送一个通知作为确认，这可能是为了确保用户知道有新的消息并且已经被成功接收。
3、未完全加载或处理：在某些情况下，可能是由于短信通知尚未完全加载或处理，导致通知仍然显示，尝试重新启动设备或等待一段时间，看问题是否解决。
4、应用缓存或数据问题：长时间使用短信应用可能会产生缓存或数据问题，可以尝试清除应用的缓存和数据，然后重新登录，看问题是否解决。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系手机制造商的客服或访问相关的技术支持论坛，获取更专业的帮助。